武書連2015獨立學院評價，繼續沿用本科大學的評價體系。區別在于，根據國家對獨立學院的定位，考慮到獨立學院以培養應用型人才為主，2015獨立學院評價人才培養權重所占比例較高，為84.50%;科學研究權重所占比例較低，為15.50%。而同一年度普通高等學校該兩項指標的比例是：人才培養56.75%，科學研究43.25%。
與上一年度相比，2015獨立學院評價，取消了國家自然科學基金立項數、國家社科基金立項數兩項指標，原因是大部分獨立學院該兩項指標都是以主辦學校名義申請的。
排名在200名之后的獨立學院只列出分省排名，不列全國排名。
新疆自治區獨立學院綜合實力排行榜
| 分省排名 | 全國排名 | 校名 | 學校類型 | 學校參考類型 | 備注 | |
| 1 | 新疆醫科大學厚博學院 | 醫藥 | 醫學類 | 教學1型 | ||
| 2 | 新疆大學科學技術學院 | 綜合 | 文理類 | 教學2型 | ||
| 3 | 新疆財經大學商務學院 | 財經 | 管理類 | 教學2型 | ||
| 4 | 新疆農業大學科學技術學院 | 農業 | 文理類 | 教學2型 | ||
| 5 | 石河子大學科技學院 | 綜合 | 綜合類 | 教學1型 | ||